3 Temmuz 1992 tarih ve 3837 sayılı Kanun ile kurulan ve adını Büyük Taarruzun kilit noktalarından biri olan “Kocatepe”den alan Üniversitemizin geçmişi, 1974 yılında Eskişehir İktisadi ve Ticari İlimler Akademisi’ne bağlı olarak kurulan Afyon Maliye Muhasebe Yüksekokuluna dayanmaktadır.

1987 yılında Anadolu Üniversitesi’ne bağlı Afyonkarahisar İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi haline dönüştürülen İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi, kuruluşu sırasında Üniversitemize bağlanmış; benzer şekilde Ege Üniversitesi’ne bağlı Uşak Meslek Yüksekokulu (MYO), Anadolu Üniversitesi’ne bağlı Afyon MYO ile Bolvadin MYO da kuruluşundan sonra Üniversitemize bağlanmıştır.

1992 yılında Üniversitemizin kuruluş süreciyle birlikte Afyonkarahisar’da Fen-Edebiyat Fakültesi, Teknik Eğitim Fakültesi, Sosyal Bilimler Enstitüsü, Fen Bilimleri Enstitüsü ve Atatürk Sağlık Hizmetleri MYO; Uşak’ta Uşak Eğitim Fakültesi ve Uşak Mühendislik Fakültesi kurulmuştur.

Kuruluşundan itibaren Afyonkarahisar ve Uşak’ta yeni akademik birimleri ile büyümeye başlayan Üniversitemiz; 1993 yılında Dinar, Emirdağ, Sandıklı ve Şuhut ilçelerinde kurulan Dinar MYO, Emirdağ MYO, Sandıklı MYO ve Şuhut MYO ile birlikte Uşak’ta kurulan Sağlık Hizmetleri MYO, Banaz, Eşme ve Karahallı ilçelerinde kurulan Banaz MYO, Eşme MYO ve Karahallı MYO ile gelişimini sürdürmüştür.

1994 yılında Afyonkarahisar’ın Çay ve Emirdağ ilçelerinde, Uşak’ın Ulubey ilçesinde kurulan Çay MYO, Emirdağ MYO ve Ulubey MYO’yu, 1995 yılında Afyonkarahisar’da kurulan Veteriner Fakültesi, Afyonkarahisar’ın Sinanpaşa (Sincanlı) ve Sultandağı ilçelerinde kurulan Sincanlı MYO ve Sultandağı MYO izlemiştir.

1996 yılında Afyonkarahisar’da Afyon Sağlık Yüksekokulu kurulduktan sonra 1998 yılında Afyonkarahisar’da Tıp Fakültesi, Uşak’ın Sivaslı ilçesinde de Sivaslı MYO kurulmuştur.

Afyonkarahisar’ın kültür-sanat yaşamının değişimine önemli katkılarda bulunan Üniversitemiz Devlet Konservatuvarı 1999 yılında kurulurken, aynı yıl Uşak’ta da Uşak Fen-Edebiyat Fakültesi hizmet vermeye başlamıştır.

Bu süre içinde 5 doktora, 12 yüksek lisans, 41 lisans ve 105 önlisans programında eğitim-öğretim faaliyeti gerçekleştirilmiştir.

1992-1998 yılları arasında; 1993 yılında 83, 1994 yılında 160, 1995 yılında 691, 1996 yılında 1.429, 1997 yılında 2.640, 1998 yılında 2.851 olmak üzere toplam 7.854 öğrenci, Üniversitemizden mezun olmuştur.